Converter arquivos no Linux nunca foi uma tarefa muito agradável para muitos usuários apressados, graças às opções dos programas de conversão. Para isso, aqui está disponível uma lista com algumas opções de conversão e também, qual programa utilizar para cada tipo de arquivo. Vamos também frizar que, converter arquivos pelo terminal é muito mas muito mais rápido  e por isso não utilizo programas como o WinFF. Vamos lá?

De RMVB para AVI:

$ mencoder ARQUIVO.rmvb -oac mp3lame -lameopts br=192 -ovc lavc -lavcopts vcodec=mpeg4:vhq -o NOVOARQUIVO.avi

De WMV para AVI:

$ mencoder ARQUIVO.wmv -ofps 23.976 -ovc lavc -oac copy -o NOVOARQUIVO.avi

De MOV para AVI:

$ mencoder -ovc lavc -lavcopts vcodec=mpeg4 -oac mp3lame -lameopts vbr=3 ARQUIVO.mov -o NOVOARQUIVO.avi -v

De FLV para MPG:

$ ffmpeg -i ARQUIVO.flv -r 60 -ab 56 -ar 22050 -b 500 -s 320x240 NOVOARQUIVO.mpg

De MPG para AVI:

$ mencoder ARQUIVO.mpg -ovc xvid -oac mp3lame -xvidencopts bitrate=800 -o NOVOARQUIVO.avi

Para juntar legendas em arquivos *.avi

nome=`basename $arq .avi`
mencoder arquivo.avi -sub $arquivo.srt -subpos 95 -oac mp3lame -lameopts cbr:br=64 -ovc lavc -lavcopts vcodec=msmpeg4:vbitrate=967 -o coisa.avi

De FLV para MP3:

ffmpeg -i moviet.flv -f mp3 sound.mp3

Se você tem pavor da linha de código, procure um programa como o WinFF, que está disponível nos repositórios do Ubuntu para pronta instalação.

Lembrando que, todos esses programas como mencoder e ffmpeg estão disponíveis nam aioria das distribuições Linux. Não vou citar como instalá-los, pois é uma tarefa simpels.  Espero que seja útil!